MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV3

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015179	GCC	2	6	1756	1761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015179	GGGA	2	8	2019	2026	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015179	GCCG	2	8	2136	2143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015179	TCC	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015179	CAA	2	6	2208	2213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015179	GTG	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015179	GCG	2	6	2299	2304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015179	ACG	2	6	2305	2310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015179	TCG	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015179	TGG	2	6	2336	2341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015179	GCC	2	6	2353	2358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015179	CA	3	6	2471	2476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015179	GC	4	8	2506	2513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015179	CGGC	2	8	2520	2527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015179	GCCC	2	8	2549	2556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_015179	GTA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015179	CGC	2	6	2580	2585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015179	GA	3	6	2593	2598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015179	CGG	2	6	3739	3744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015179	CGA	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015179	ATG	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015179	CCGGA	2	10	6107	6116	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015179	CGC	2	6	6131	6136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015179	GTG	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015179	GCC	2	6	6170	6175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015179	CGG	2	6	6211	6216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015179	ATC	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015179	CTC	2	6	6302	6307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015179	GGGA	2	8	6331	6338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015179	GC	3	6	6359	6364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015179	TCC	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015179	GGCT	2	8	6455	6462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015179	C	7	7	6549	6555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_015179	GAATA	2	10	7544	7553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015179	GCT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015179	AAG	2	6	7631	7636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015179	GAT	2	6	7661	7666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015179	CTTG	2	8	7693	7700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015179	AAC	2	6	7725	7730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015179	CTG	2	6	7785	7790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015179	GCC	2	6	7863	7868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015179	CGC	2	6	7887	7892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015179	CA	3	6	7946	7951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015179	ACC	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015179	AAATC	2	10	8082	8091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015179	TTG	2	6	8099	8104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015179	GCG	2	6	10246	10251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015179	CGC	2	6	10252	10257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015179	GCCGG	2	10	12243	12252	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015179	CTT	2	6	12333	12338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015179	T	6	6	12337	12342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015179	A	6	6	12345	12350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015179	A	6	6	12356	12361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015179	T	7	7	12362	12368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015179	T	8	8	12417	12424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015179	TCT	2	6	12428	12433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015179	A	8	8	12440	12447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015179	TCT	2	6	12459	12464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015179	ATC	2	6	12483	12488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015179	A	6	6	12524	12529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015179	A	6	6	12535	12540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015179	TAA	2	6	12549	12554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015179	CTG	2	6	16365	16370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015179	CAT	2	6	16371	16376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015179	CCGC	2	8	16386	16393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_015179	CA	3	6	16405	16410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015179	CGG	2	6	16458	16463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015179	CATG	2	8	16485	16492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015179	TTTA	2	8	16510	16517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015179	AGT	2	6	16560	16565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015179	CTGAAT	2	12	17217	17228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015179	GTA	2	6	17230	17235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015179	TCTGA	2	10	17316	17325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015179	TGC	2	6	17329	17334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015179	AT	3	6	18344	18349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015179	AT	3	6	18374	18379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015179	CAT	2	6	18382	18387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015179	GCC	2	6	18402	18407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015179	CCG	2	6	19361	19366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015179	GGC	2	6	19404	19409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015179	CGA	2	6	20778	20783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015179	AC	3	6	20803	20808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015179	GCAA	2	8	20865	20872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015179	ATG	2	6	20910	20915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015179	GGCC	2	8	24019	24026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015179	TCG	2	6	24101	24106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015179	AGT	2	6	24777	24782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015179	ACT	2	6	24789	24794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015179	TA	3	6	24832	24837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015179	AG	3	6	24869	24874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015179	CAG	2	6	25024	25029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015179	GCGG	2	8	25038	25045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015179	CGC	2	6	25080	25085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015179	CGAAC	2	10	25092	25101	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015179	CCT	2	6	25106	25111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015179	TCTGA	2	10	25170	25179	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015179	ACG	2	6	27374	27379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015179	AGG	2	6	27388	27393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015179	TC	3	6	27421	27426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015179	CG	3	6	27502	27507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015179	GACC	2	8	27518	27525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015179	TTGAT	2	10	27682	27691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015179	TCA	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015179	GA	3	6	27837	27842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015179	CCG	2	6	27869	27874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015179	TA	3	6	28398	28403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015179	GA	3	6	28406	28411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015179	GGA	2	6	28415	28420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015179	AG	3	6	31060	31065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015179	GTGG	2	8	31156	31163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015179	CGGG	2	8	31202	31209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015179	TAG	2	6	33351	33356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015179	AGC	2	6	34617	34622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015179	TCGG	2	8	34638	34645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015179	GTT	2	6	34692	34697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015179	CGA	2	6	34713	34718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015179	AAG	2	6	34747	34752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015179	GTA	2	6	34768	34773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015179	GTG	2	6	34849	34854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015179	CGAT	2	8	34866	34873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015179	GCG	2	6	34886	34891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015179	TTC	2	6	34919	34924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015179	GCC	2	6	34962	34967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015179	CCT	2	6	35411	35416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015179	GCG	2	6	35919	35924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015179	TCC	2	6	36853	36858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015179	GC	3	6	37802	37807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015179	CTG	2	6	37822	37827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015179	ACG	2	6	37844	37849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015179	GCC	2	6	37858	37863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015179	ATC	2	6	38165	38170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015179	TAC	2	6	38195	38200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015179	TG	3	6	38251	38256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015179	TCT	2	6	38297	38302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015179	TGCGG	2	10	38329	38338	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015179	TGCGG	2	10	38342	38351	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015179	AGC	3	9	40945	40953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015179	AAC	2	6	40985	40990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015179	GTC	2	6	42202	42207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015179	CA	3	6	42217	42222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015179	CTG	2	6	42304	42309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015179	TGC	2	6	43314	43319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015179	AGC	2	6	43996	44001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015179	CGG	2	6	44071	44076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015179	ACC	2	6	44336	44341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_015179	AC	3	6	44365	44370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015179	CCGGAT	2	12	44565	44576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015179	ATG	2	6	44585	44590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015179	CGA	2	6	44634	44639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015179	GAT	2	6	44640	44645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015179	ACG	2	6	44668	44673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015179	CCCG	2	8	44675	44682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_015179	CAG	2	6	44683	44688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015179	ATG	2	6	44735	44740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015179	GGC	2	6	44744	44749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015179	CCA	2	6	47207	47212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_015179	CTA	2	6	48308	48313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015179	GC	3	6	49024	49029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_015179	CGC	2	6	49032	49037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_015179	GCT	2	6	49067	49072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_015179	TCC	2	6	49086	49091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_015179	CGC	2	6	49775	49780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_015179	GCC	2	6	49792	49797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_015179	A	6	6	50157	50162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015179	T	7	7	50166	50172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015179	A	6	6	50181	50186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015179	T	6	6	50188	50193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015179	TAC	2	6	50222	50227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015179	CG	3	6	50259	50264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_015179	TTG	2	6	50451	50456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015179	AGG	2	6	50477	50482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015179	GAC	2	6	51460	51465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_015179	CTCG	2	8	51528	51535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_015179	GCCC	2	8	51575	51582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
175	NC_015179	TGCCC	2	10	51608	51617	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
176	NC_015179	GCC	2	6	51620	51625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_015179	AG	3	6	51737	51742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015179	TA	3	6	51790	51795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015179	GTCGCT	2	12	51810	51821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_015179	TCA	2	6	51833	51838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_015179	GCT	2	6	51956	51961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_015179	GCA	2	6	51990	51995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_015179	AATCG	2	10	53633	53642	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_015179	GAA	2	6	53777	53782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015179	CGAA	2	8	53797	53804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_015179	CGGG	2	8	54082	54089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
187	NC_015179	GTG	2	6	54114	54119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015179	T	6	6	54169	54174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015179	CTG	2	6	54196	54201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_015179	GGA	2	6	54238	54243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.